丹巴的宗教传承纳入了清朝严密的管控体系之中，使其再也难以摆脱清朝的控制。

而在康熙二十七年，也就是 1688 年，准噶尔部的噶尔丹野心勃勃，悍然入侵漠北。哲布尊丹巴一世在慌乱之中，只能无奈地随喀尔喀王公们逃往漠南，向清朝寻求庇护。康熙表面上热情接纳了他们的部众，还假惺惺地拨给牧场、修建寺庙，比如那颇具标志性的多伦汇宗寺。然而，清朝的真实目的，不过是想借此让哲布尊丹巴一世在政治上彻底依附于清朝。这种所谓的 “庇护”，更是强化了漠北蒙古 “唯有依附清朝才能保障宗教存续” 的错误认知，让他们在不知不觉中陷入了清朝精心编织的统治罗网。

朱慈烺想到这里，心中一阵厌恶：“这清朝如此手段，看似为漠北蒙古提供庇护，实则是在一步步侵蚀他们的自主权，实在阴险。朕定不会如此对待漠北蒙古，朕要让他们感受到我大明的诚意与仁德。”

清朝还极为狡猾地以寺庙为重要支点，将宗教空间巧妙地转化为统治据点。他们通过资助修建寺庙、赋予寺庙各种特权，使得这些宗教场所摇身一变，成为连接清朝与漠北蒙古的 “行政 - 文化节点”。如此一来，清朝既巩固了自身在宗教领域的影响力，又实现了对蒙古社会的间接管理，可谓一箭双雕。