若不尽快平息，必将后患无穷。” 为稳定西藏局面，清廷于 1713 年册封五世班禅为 “班禅额尔德尼”，试图以此来平衡达赖喇嘛的势力。

1719 年，准噶尔部盘踞拉萨，妄图搅乱西藏局势，从中谋取私利。康熙帝果断下令：“派军队进入西藏，驱逐准噶尔部，护送格桑嘉措从青海回西藏坐床。”

当然了，朝堂之中也是有反对的声音的。在反对声中，康熙帝对着群臣说：“朕定要让西藏重归安宁，绝不容许这些跳梁小丑肆意妄为！” 随后，康熙正式下诏敕封格桑嘉措为 “弘法觉众第六辈达赖喇嘛”，命他 “阐扬佛教，辅朕大业”。

1709 年，康熙帝坐在御书房中，看着西藏的地图，思索着如何进一步加强对西藏的管理。他对身旁的大臣说道：“西藏事务繁杂，仅靠当地势力难以维持长久稳定。派侍郎赫寿进藏协同拉藏汗办理西藏事务，密切关注局势变化。” 这一举措，被看作是清朝设置驻藏大臣的先声。

1727 年，大清朝廷正式设驻藏大臣，代表中央监督西藏地方行政，进一步加强了对达赖喇嘛及西藏地方的管理。

1793 年，大清朝廷颁布了《钦定藏内善后章程》，共二十九条。